Verksamhetsutveckling
I rollen som central prov- och försöksledare är det FHTEs uppgift att bereda och initiera försök med till exempel materiel, fordon, hundförarutrustning, samt ta fram handböcker och andra styrdokument för hundtjänsten. Inom området utveckling av materiel sker samverkan med Försvarets materielverk och förband som bedriver hundtjänst.
Forskning
För att hundtjänsten ska stå på en vetenskaplig grund bedriver FHTE forskning tillsammans med FOI (Totalförsvarets forskningsinstitut). Forskningen har skett mestadels inom min- och explosivämnessöksområdet.