Funktionsansvaret innebär att FM DNC är utbildningsansvarig för Försvarsmaktens grundläggande dykutbildning. Här ingår fri uppstigning, nödluft för helikopter- och fordonspersonal. Ansvar för den tillämpade dykutbildningen delas mellan FM DNC och förbanden.
Inom dykutveckling är FM DNC ansvarig för prov- och försöksverksamhet inom teknik, fysiologiska försök, dykerisäkerhet och test av my materiel. FM DNC har ett mycket nära samarbete med Kungliga Tekniska Högskolan i Stockholm och Blekinge Tekniska Högskola i Karlskrona inom utvecklings- och dykerisäkerhetsområdet.
FM DNC finns i Karlskrona. Utöver chef med stab är FM DNC organiserad i tre sektioner: utvecklingssektionen, navalmedicinska sektionen och dykarskolan.